Option 3 in the MAIN MENU is a menu consisting of logical flags that control various  operational aspects of SIMIND. The flags are set/reset by giving the appropriate flag  number. The flags are defined as follows:

Determine whether on-line printout and results will be written to the terminal during the  actual simulation. This flag should be turned off when submitting a command procedure  to a batch queue. 

Determine whether a binary image file [*.bim] that will store a calculated planar image  should be created. The actual calculation of the matrix is not affected by this flag.

Determine whether a binary energy pulse-height distribution file [*.bis] should be  created. As for Flag 2, this does not affect the calculation of the different detector  parameters that are derived from the energy spectra. 

Include simulation of a scintillation camera collimator. The values in Indices 45- 53 of  the GENERAL DATA menu are thus incorporated into  SIMIND. 

Determine if a SPECT simulation will be done. If this flag is set then the total number of  photon histories in the SPECT simulation will be the number of photon histories per  projection multiplied by the number of projection angles. Invoking Flag 5 sets Flag 2 to  FALSE.

Include simulation of characteristic K-a x-ray photons emitted from a photoelectric  absorption site in the crystal. 

Include a volume behind the crystal to simulate scattering in light guides and PMT. The  thickness is given by index 11. The number of scatter order is default 3 and can be  change by editing the block data section in SIMIND.for 

Controls the sequence of the random number generator. If set to FALSE, then the same  initial seed will be used. In this case, no statistical differences will be noticed between  different simulations of identical imaging systems. This function is valuable when tracing  errors. For a normal procedure, the flag should, however, be set to TRUE. 

Simulation of transmission SPECT Imaging. Transmission simulations require an image-  based phantom to work.

This option includes the simulation of the protection cover. The cover is defined by its  cross-section file [in the MAIN MENU of  CHANGE] and the thickness of the layer [index  13]. 

This option takes into account the simulation of the phantom. The dimensions of the  phantom are given by index's 5-7 or if index 14 is negative, index's 31- 38. Be sure to  have a valid file name for the non-homogeneous phantom file when setting index 14 to a  negative number. 

This flag incorporates the energy resolution and the intrinsic spatial resolution into  action in the simulation. The actual values for the system are defined by indices 22 and  23. If this flag is reset, then the energy pulse-height spectra will reflect the imparted  energy in the scintillation crystal and not counts from simulated scintillation light that  may be affected by statistical fluctuations. 

This option forces the photons to interact in the crystal by invoking variance reduction  techniques. This option is useful when simulating high energy photons that are impinging   on thin crystals or when simulating a low-density detector. The calculated detector  parameter is not affected by this option since the weight of each photon is adjusted for  the forced interaction. 

If this flag is true then the files storing the image and the SPECT projection data will  have a header of the Interfile version 3.3 format. This format has been developed to  establish a way of communicate between different nuclear medicine units. The specific  SIMIND parameters has a prefix of ;# and is thus treated as comments by an external  system.

If this flag is true then a file of the phantom is stored that is re-sampled to the pixel  size and slice thickness for the corresponding SPECT image. The base name for the file  is the same as the density map file [Index 14 in the main menue] he content in the file  are in units of density and times 1000. The extension is *.ict for the actual images and  *.hct for the interfile header. Note that these files is only created if